準備工作
設備校準:在開始測序之前,需要對基因測序儀進行校準,確保其性能符合標準。
樣本準備:
DNA提取:從生物樣本(如血液、組織等)中提取DNA。
文庫構建:將提取的DNA打斷成小片段,然后進行末端修復、加A尾、接頭連接等步驟,構建成適合測序的文庫。
樣本質量控制:對構建好的文庫進行定量和質控,確保文庫的質量。
測序步驟
上機測序:
將合格的文庫樣本添加到測序反應體系中。
將反應體系加載到測序儀的樣本板(或芯片)上。
測序反應:
PCR擴增:對文庫樣本進行PCR擴增,以增加目標區域的DNA量。
測序:測序儀會逐個讀取DNA片段的序列信息。
測序儀會按照預定的測序流程進行反應,通常包括以下步驟:
數據收集:
測序儀會將測序結果以圖像或數據流的形式輸出。
數據分析:
質量控制:去除低質量序列。
序列拼接:將測序得到的短讀段拼接成長序列。
比對:將拼接后的序列與參考基因組比對,確定變異位點。
變異注釋:對檢測到的變異進行功能注釋。
將測序數據導入生物信息學軟件進行分析,包括:
后續操作
結果解讀:根據數據分析結果,解讀測序數據,得出生物學結論。
報告生成:將分析結果整理成報告,供臨床或研究使用。
注:文章來源于網絡,如有侵權,請聯系刪除