PCR擴(kuò)增儀又稱為PCR基因擴(kuò)增儀、PCR核酸擴(kuò)增儀、聚合酶鏈反應(yīng)核酸擴(kuò)增儀,是利用PCR技術(shù)對(duì)特定DNA擴(kuò)增的一種儀器設(shè)備。
PCR儀的工作原理
PCR屬于一種用來(lái)放大擴(kuò)增特定DNA片段的分子生物學(xué)技術(shù),能夠看作是生物體外的特殊DNA復(fù)制,PCR的大特點(diǎn),就是能夠把微量的DNA大幅增加。
不管是化石中的古生物、幾十年前兇殺案中兇手遺留下的毛發(fā)、皮膚或者是血液,只要能夠分離出一丁點(diǎn)的DNA,那么就可以使用PCR來(lái)放大,進(jìn)行對(duì)比。
PCR是利用DNA在體外攝氏95度高溫時(shí)變性時(shí)會(huì)變成單鏈、低溫時(shí)引物和單鏈按照堿基互補(bǔ)配對(duì)的原則來(lái)結(jié)合,再調(diào)溫度到DNA聚合酶適反應(yīng)溫度,DNA聚合酶沿著磷酸到無(wú)碳糖的方向合成互補(bǔ)鏈。給予聚合酶制造的PCR儀實(shí)際上就是一個(gè)溫控設(shè)備,能夠在變性溫度、復(fù)性溫度以及延伸溫度之間進(jìn)行很好的控制。
DNA的半保留復(fù)制可以說(shuō)是生物進(jìn)化和傳代的重要途徑。
PCR儀的分類
普通PCR儀:只進(jìn)行PCR擴(kuò)增的PCR儀,實(shí)際上是一個(gè)溫控設(shè)備。只能實(shí)現(xiàn)DNA的擴(kuò)增,分析檢測(cè)需要在擴(kuò)增之后。而擴(kuò)增后到檢測(cè)分析的這個(gè)過(guò)程中,要將樣品中儀器中取出來(lái),容易受到污染和污染環(huán)境。
實(shí)時(shí)熒光PCR儀:在普通PCR儀的基礎(chǔ)上增加熒光信號(hào)采集系統(tǒng)和計(jì)算機(jī)分析處理系統(tǒng)。在作為溫控設(shè)備的同時(shí)加入熒光分析系統(tǒng)。
PCR儀是用來(lái)做什么的
所采集到的樣品含量太低,無(wú)法正常的用儀器進(jìn)行檢測(cè)分析時(shí)需要通過(guò)PCR儀PCR技術(shù)來(lái)實(shí)現(xiàn)樣品擴(kuò)增,擴(kuò)增的倍數(shù)2N次方。
通過(guò)這個(gè)技術(shù),可以用于:
(1)分子生物學(xué)研究:核酸定量分析,基因表達(dá)差異分析等等。
(2)醫(yī)學(xué)研究:產(chǎn)前診斷,病原體檢測(cè)如最近的新冠病毒等等方面。
PCR儀怎么選擇
標(biāo)準(zhǔn) PCR儀主要是產(chǎn)生大量的核酸序列供后續(xù)實(shí)驗(yàn)使用,比如測(cè)序、克隆,或僅僅是為了在凝膠上看看有沒有合適的條帶。
QPCR則是實(shí)時(shí)定量靶序列,通常被用來(lái)測(cè)定生物分子的豐度,而不是生成終產(chǎn)物。“有了QPCR,研究人員就不再關(guān)心PCR 產(chǎn)物發(fā)生了什么。
數(shù)字PCR也是定量的,但并非實(shí)時(shí)。反應(yīng)發(fā)生在大量的微小分區(qū)中。這些分區(qū)很小,其中每個(gè)可能包含0或1個(gè)DNA分子,通過(guò)計(jì)算陽(yáng)性反應(yīng)的數(shù)量,研究人員能夠真正定量DNA。這比 QPCR更為靈敏,也不需要標(biāo)準(zhǔn)曲線。
對(duì)于標(biāo)準(zhǔn)PCR儀和定量PCR儀之間的選擇,研究人員通常都心里有數(shù)。數(shù)字PCR通常能提供一個(gè)更好的答案,更明確的答案。
PCR儀的校準(zhǔn)參數(shù)
在反應(yīng)的過(guò)程中,溫度示值與設(shè)定值是否準(zhǔn)確,這是第一個(gè)溫度示值誤差;因?yàn)槲覀冃枰郎兀禍兀郎兀@是不是涉及到一個(gè)速率的問題,升降溫的快慢,會(huì)直接影響到整個(gè)反應(yīng)過(guò)程,所以,升降溫速率也是我們需要考量的一個(gè)方向。
儀器通過(guò)加熱模塊去控制溫度,在快速升降溫的過(guò)程中,儀器不可避免的會(huì)先升高/降低溫度之后,再達(dá)到所設(shè)定的問題,這就是溫度的過(guò)沖,這也是可能也是一個(gè)考量的指標(biāo)。
達(dá)到一定的溫度之后,儀器要平衡一段時(shí)間,而溫度平衡的時(shí)間和設(shè)置的時(shí)間,是否一致,也是要考慮的一個(gè)方向。
不同的DNA模板,需要的溫度和解鏈的時(shí)間不一樣,如果解鏈的時(shí)間沒達(dá)到要求,DNA沒有完全變性,在降溫復(fù)性的過(guò)程中,會(huì)恢復(fù)到天然的狀態(tài)。
PCR儀有48孔、96孔,384孔,每一個(gè)孔都可以放一個(gè)樣品,自然我們上面所說(shuō)的溫度參數(shù),還是有一些不全。
這里大致總結(jié)一下:溫度示值誤差、溫度均勻性、溫度最大沖量、溫度持續(xù)時(shí)間準(zhǔn)確度、平均升降溫速率,最大升降溫速率等。
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