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１、原液儲存：戊二醛消毒器內部通常設置有專門的儲存槽，用于存放戊二醛的原液。
２、稀釋和調配：當需要進行消毒時，系統會自動從儲存槽中取出適量的戊二醛原液，并與水進行稀釋和調配，形成一定濃度的戊二醛溶液。
３、循環噴霧：戊二醛溶液通過泵或壓力系統被噴霧器噴入消毒區域，形成細小的顆粒狀霧狀物質。
４、消毒作用：戊二醛溶液中的戊二醛分子具有較強的殺菌和滅活作用。當噴霧的戊二醛溶液與微生物接觸時，戊二醛分子會與微生物細胞壁、細胞膜和細胞內的重要功能蛋白發生反應，破壞其結構和功能，從而達到殺滅微生物的目的。
５、氣化和蒸發：戊二醛溶液噴霧后會迅速氣化和蒸發，將戊二醛分子散布到整個消毒區域。由于戊二醛具有較低的蒸汽壓和揮發性，故能長時間停留在空氣中，保持一定的殺菌濃度。
６、通風處理：為了防止戊二醛在空氣中積累過高而對人體產生危害，戊二醛消毒器通常會設置通風裝置，在消毒結束后通過強制排風將殘余的戊二醛排出。
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